Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms