Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTRAFQ9CQE8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RTRAFQ9CQE8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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