Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms