Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms