Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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