Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb6Q922F4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms