Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4bQ91ZP4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms