Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atpaf2Q91YY4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atpaf2Q91YY4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms