Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx11Q91WL6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx11Q91WL6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms