Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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