Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms