Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nae1Q8VBW6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nae1Q8VBW6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms