Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2E3

Vmn1r36, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r36Q8R2E3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vmn1r36Q8R2E3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r36Q8R2E3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms