Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rab11fip3Q8CHD8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab11fip3Q8CHD8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms