Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ercc8Q8CFD5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ercc8Q8CFD5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ercc8Q8CFD5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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