Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms