Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E4f1Q8CCE9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E4f1Q8CCE9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms