Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfrp1Q8BXL7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfrp1Q8BXL7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms