Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms