Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo1Q7TT28 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo1Q7TT28 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms