Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nek5Q7TSC3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek5Q7TSC3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms