Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Actn1Q7TPR4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actn1Q7TPR4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms