Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd300lfQ6SJQ7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms