Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc82Q6PG04 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms