Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf4Q6PFF0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms