Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms