Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt40Q6IFX3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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