Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KdsrQ6GV12 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KdsrQ6GV12 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms