Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kpna1Q60960 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms