Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms