Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms