Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc5a6Q5U4D8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a6Q5U4D8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms