Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav6-2Q5R1I4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms