Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms