Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc114Q3UX62 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc114Q3UX62 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms