Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScimpQ3UU41 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms