Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3b2Q3UJB0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms