Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil3Q3UFQ8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms