Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Puf60Q3UEB3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms