Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Fndc4Q3TR08 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc4Q3TR08 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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