Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b1Q148W0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b1Q148W0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms