Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssrp1Q08943 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssrp1Q08943 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms