Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgm3Q08189 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms