Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn1Q08091 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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