Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox4Q06831 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox4Q06831 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox4Q06831 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox4Q06831 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox4Q06831 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox4Q06831 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox4Q06831 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox4Q06831 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox4Q06831 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox4Q06831 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox4Q06831 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox4Q06831 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox4Q06831 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms