Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD51Q06609 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD51Q06609 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD51Q06609 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD51Q06609 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD51Q06609 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAD51Q06609 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD51Q06609 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD51Q06609 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD51Q06609 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD51Q06609 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms