Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms