Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col1a2Q01149 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a2Q01149 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms