Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa1Q00623 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms