Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra1P97785 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms